Los gérmenes que causan infecciones vaginales cuando una mujer está en edad fértil, pueden ser diferentes que los que causan infecciones en niñas y en mujeres en menopausia. Esto se debe a que los cambios hormonales favorecen ciertos gérmenes.
Pero cuando el nivel de estrógenos baja, cuando la mujer deja de tener menstruaciones, los lactobacilos ya no forman parte de la flora normal y no cumplen su función protectora. De modo que puede haber una tendencia a desarrollar infecciones vaginales en la menopausia, causadas por bacilos de origen intestinal.